Агентство по инновациям и трансферу технологии было создано в составе Академии Наук Молдовы 29 октября 2004 г. в соответствии с Кодексом о науке и инновациях Республики Молдова (N.259-XV от 15.07.2004), во времена больших государственных перемен в целях координации, стимулирования и внедрения механизмов деятельности в области инноваций и трансфера технологий. В настоящее время Агентство играет роль прагматичного центра, который объединяет ученых, представителей государственных органов и бизнес - их сотрудничество, будучи продиктовано провокациями/проблемами современности, а также обязательствами Республики Молдова перед международным сообществом.
В целях ускорения процесса сближения стандартов Республики Молдова к стандартам Евро Союза - пространство в котором именно инновации основывают фундамент социально-экономического прогресса, АИТТ взяла на себя ответственность быстрой имплементации инноваций и новейших технологий в промышленном секторе, ориентируясь в этом плане по примеру западной системы и таким образом способствуя модернизации и социально-экономическому росту страны а также улучшению жизненных условий населения.
Так, в 2005 г. была осуществлена первая практика технологического трансфера, в котором государство сигнализируя рынку о том что оно готова поддерживать инновации, участвовала в софинансировании реализации проектов технологического трансфера. Понятно, что на том этапе было много недоверия к качеству тех научных результатов, потому что до 2004 г. имело место длинный упадок науки, поэтому эти первые проекты были первыми ласточками и очень многие люди смотрели на них и ждали что из этого выйдет. Надо отметить, что эта практика оказалась положительной, и мы ее продолжаем до сих пор.
В 2006 г. - начало 2007 г. когда стало понятно, что необходимы дополнительные инструменты для развития инновационной экономики, не стали придумывать ничего нового, просто обратились к практике зарубежных стран и обнаружили что за рубежом имеют место быть такие организационные формы как инновационные инкубаторы и научно-технологические парки. После принятия Парламентом РМ Закона о научно-технологических парках и инновационных инкубаторах, который предусматривает либеральный режим деятельности, а также налоговые и таможенные льготы, решением Высшего совета по науке и технологическому развитию АН Молдовы от 30 августа 2007 г. были учреждены первые в стране научно-технологический парк "Аcademica" и инновационный инкубатор "Inovatorul" - эти организации представляя самое оптимальное решение проблем молдавского предпринимательства, благодаря множества представляемы разнообразных стратегических и материально-технических услуг для их благотворного развития.