Structurile principale în sistemul infrastructurii inovaţionale sunt parcurile ştiinţific-tehnologice şi incubatoarele de inovare. Acestea oferă rezidenţilor săi – firmelor inovaţionale, un pachet de servicii: spaţii, construcţii şi dotări, suplimentate cu o întreagă serie de prestaţii materiale, informaţionale, de personal, financiare, de expertiză şi consultanţă.
În rezultatul concursului între instituţiile superioare de învăţămînt, CSŞDT prin Hotărârea Nr. 57 din 24 martie 2011 a aprobat proiectul “Fondarea şi organizarea incubatorului de inovare “POLITEHNICA”, crearea şi dezvoltarea infrastructurii acestuia în anul 2011” şi a fost desemnată ca administrator Universitatea Tehnică a Moldovei. Actualmente se realizează proiectul de organizare şi creare a incubatorului.
În rezultatul concursului între instituţiile superioare de învăţămînt, CSŞDT prin Hotărârea Nr. 149 din 21 iulie 2011a fost aprobat proiectul “Fondarea incubatorului educaţional şi inovaţional “UNIVERSIENCE” şi a fost desemnată ca administrator Univesitatea Academiei de Ştiinţe a Moldovei pentru realizarea proiectului de organizare şi creare a incubatorului.
Parcul ştiinţifico-tehnologic „ACADEMICA” este una dintre primele în ţară structuri de inovare, create în baza Întreprinderii de Stat Uzina Experimentală „ASELTEH”, amplasate pe adresa: mun.Chişinău, str.Mioriţa, 5.
În luna iulie 2008 Consiliul Suprem pentru Ştiinţă şi Dezvoltare Tehnologică a adoptat Hotărârea nr.155 din 17.07.2008 privind crearea Parcului ştiinţifico-tehnologic “INAGRO” în baza complexului ştiinţific de producţie, ce aparţinea Institutului de Protecţie a Plantelor şi Agricultură Ecologică.
În luna aprilie 2009 Consiliul Suprem pentru Ştiinţă şi Dezvoltare Tehnologică a adoptat Hotărârea nr.62 din 30.04.2009 privind crearea Parcului ştiinţifico-tehnologic “MICRONANOTEH” în domeniul microelectronicii şi nanotehnologiilor în spaţiile Institutului de Cercetări Ştiinţifice S.A. „ELIRI”.
Baza ştiinţifică şi de producţie a noului parc va include spaţii cu suprafaţa totală de 320 mp, conectate la reţelele inginereşti, reţelele informaţionale.
În rezultatul adoptării Hotărârii Consiliului Suprem pentru Ştiinţă şi Dezvoltare Tehnologică al AŞM nr.173 din 30 august 2007 a fost creat Incubatorul de inovare „INOVATORUL”.